耳道原有的健康上皮黏膜及耳垢分泌酵素（耵聹腺），可抵抗外來細菌及黴菌；當此黏膜有損傷（如不當的過度挖耳）或功能被破壞（如頭部放射治療後）時，遇到外物侵入（如游泳、不潔的指甲或挖耳器等）就產生感染。

外耳道黑黴菌症狀
耳朵癢、耳朵痛，黴菌堆積更多時會耳鳴及重聽，合併細菌感染時會化膿甚或肉芽腫生成。如果是慢性中耳炎（耳膜穿孔）患者，更會隨著破洞快速侵犯中耳腔。

念珠菌
酵母菌屬，以「白色念珠菌」（Candida albicans）最常見，常見於口腔、咽喉、耳道、陰道等黏膜，原為正常菌落，在免疫功能下降時可大量生長；另一少見為「耳念珠菌」（Candida auris），最早於2009年在日本被首次分離，有較強致病性。

外耳道念珠菌症狀
「白色念珠菌」，可能毫無症狀，或輕微耳道悶癢感，常常在醫師耳鏡檢查時意外發現，症狀普遍比黑黴菌輕微；「耳念珠菌」在免疫不全患者（如癌症、類固醇長期使用者）可引發全身侵襲性念珠菌症，如念珠菌菌血症、心包炎、泌尿道感染和肺炎等併發症。

耳黴菌型外耳炎的治療
包括耳鼻喉科醫師的定期局部治療及耳黴菌滴劑的使用。若外耳炎或中耳炎化膿情形嚴重，可合併口服抗生素治療，必要可做標本培養化驗。若菌絲已深植黏膜深處，必定難以一次根除，正所謂「野火燒不盡，春風吹又生」，故耳黴菌患者要有耐心接受醫師多次耳道治療處理，可能達數週到數月；縱使積極處理，仍有10～30%左右復發率。